Терминал международного аэропорта имеет современное оснащение и считается лучшим в странах СНГ среди аналогичных структур. Аэропорт связывает Бухару со многими городами, в том числе, с Москвой и Санкт-Петербургом. От терминала до исторического центра города можно добраться в рейсовом автобусе или «маршрутке», курсируют здесь и такси.
До 2005 года городскую транспортную сеть представляли автобусы и троллейбусы, сегодня в Бухаре троллейбус уже не встретить, но в любую точку города можно легко добраться автобусом, маршрутным или обычным такси. Желающих арендовать машину ждет разочарование: проката автомобилей в Бухаре нет.
Для поездок в близлежащие города или окрестности Бухары удобнее пользоваться железнодорожным транспортом. В электричках и фирменных экспрессах установлены кондиционеры, особенно актуальные в летнюю жару.