Дорожная сеть развита плохо, хорошие асфальтированные шоссе идут из Бишкека в Ош, Алма-Ату и Рыбачье, вокруг озера Иссык-Куль также проложена хорошая асфальтированная дорога. Зимой движение затрудняется заносами на перевалах. В остальных случаях дороги представляют собой либо разбитый асфальт, либо покрытые гравием или просто грунтовые дороги. В горы ездят обычно специально переделанные частные грузовики (вахтовки).
Пассажирское сообщение по железной дороге сохранилось только на севере страны, около Бишкека. Оттуда идут три дальних поезда в Москву, Екатеринбург и Новокузнецк, а также существует пригородное сообщение на запад, в Казахстан (в сторону Мерке, до разъезда 3639 км), на восток (до ст. Токмак) и местный поезд в город Рыбачье (Балыкчи) на озере Иссык-Куль. Такси действуют во всех городах и поселках Киргизии. Тарифы изначально весьма низкие, рекомендуется вызывать фирменное такси, а не частника (комфортнее и безопаснее).