Несмотря на то, что в Темрюке есть и порт, и ж/д вокзал, единственный пассажирский транспорт, которым можно сюда добраться, — это автобус. Добраться на автобусе в Темрюк можно из Сочи, Краснодара, Астрахани, Геленджика, Анапы. Ближайший аэропорт, также как и железнодорожный вокзал, находятся на расстоянии 40 км от Темрюка, в Анапе. Городской транспорт представлен четырьмя маршрутами автобуса (№№ 1, 2, 4 и 9) и четырьмя линиями маршрутного такси.