Кара-Балта - один из крупнейших транспортных узлов Чуйской области: с запада на восток его пересекают железнодорожная линия Ташкент-Тараз-Бишкек-Балыкчи и автомагистраль Ташкент-Бишкек-Алматы, имеющие межгосударственное значение. Внутри города функционирует несколько городских автобусных маршрутов представленных автобусами малой вместимости. Весьма оригинальны здесь маршрутки в виде легковых автомобилей.