Главными воздушными воротами Хьюстона является аэропорт им. Джорджа Буша. От него до центра города можно добраться на рейсовом автобусе или воспользоваться услугами такси. На территории мегаполиса функционирует два дополнительных здания аэропорта: Хобби и Эллингтон-филд. Основное направление деятельности первого аэропорта заключается в организации внутренних рейсов, второй выступает в роли запасного варианта для первых двух. Общественное транспортное сообщение включает в себя около 70 автобусных маршрутов и одну скоростную трамвайную линию. В другие города штата Техас можно попасть по железной дороге или автомобильной магистрали. В черте города большинство жителей передвигаются на личных автомобилях, из-за чего в час пик здесь образуются многокилометровые пробки.